fix: 加宽 skill_trajectory_links.atom_id 列 VARCHAR(36)->128 修复 DataError(1406)；TraceIdFilter 从 root logger 移至 handler 修复子 logger %(trace_id)s KeyError 日志刷屏；evolution scheduler 循环增加 db.rollback() 兜底；附带 models.py CRLF->LF 归一。

backend/python/app/config.py

@@ -128,7 +128,15 @@ def setup_file_logging():
     root_logger.setLevel(logging.INFO)
     root_logger.addHandler(app_handler)
     root_logger.addHandler(error_handler)
-    root_logger.addFilter(TraceIdFilter())
+
+    # TraceIdFilter 必须挂在 handler 上，而非 root logger。
+    # logger 级 filter 只对「直接经该 logger 发射」的记录生效；子 logger 的记录向上冒泡
+    # 到 root 的 handler 时不会经过 root 的 logger 级 filter，导致 %(trace_id)s 缺失并抛
+    # KeyError('trace_id')。handler 级 filter 对经它格式化的每条记录都生效。
+    _tid_filter = TraceIdFilter()
+    app_handler.addFilter(_tid_filter)
+    error_handler.addFilter(_tid_filter)
+    access_handler.addFilter(_tid_filter)
 
     # 配置访问日志专用logger
     access_logger = logging.getLogger("aiflow.access")

backend/python/app/services/evolution_service.py

@@ -96,10 +96,24 @@ class PipelineScheduler:
                             self._process_trajectory(db, traj)
                         except Exception as e:
                             logger.error(f"处理轨迹 {traj.id} 失败: {e}")
-                            traj.error_msg = str(e)[:500]
+                            # 先回滚失效事务（_process_trajectory 内 commit 失败会让 session
-                            traj.retry_count = (traj.retry_count or 0) + 1
+                            # 进入 rolled-back 状态，不回滚直接再 commit 会抛 PendingRollbackError
-                            traj.status = "error"
+                            # 并级联到外层日志），再写错误状态。
-                            db.commit()
+                            try:
+                                db.rollback()
+                            except Exception:
+                                pass
+                            try:
+                                traj.error_msg = str(e)[:500]
+                                traj.retry_count = (traj.retry_count or 0) + 1
+                                traj.status = "error"
+                                db.commit()
+                            except Exception as ce:
+                                logger.error(f"更新轨迹 {traj.id} 错误状态失败: {ce}")
+                                try:
+                                    db.rollback()
+                                except Exception:
+                                    pass
                 finally:
                     db.close()
             except Exception as e:

migrations/007_evolution_tables.sql

@@ -70,7 +70,7 @@ CREATE TABLE IF NOT EXISTS `skill_trajectory_links` (
     `skill_name` VARCHAR(200) NOT NULL,
     `user_id` VARCHAR(36) NOT NULL,
     `trajectory_id` VARCHAR(36),
-    `atom_id` VARCHAR(36),
+    `atom_id` VARCHAR(128),
     `weightscore` INT DEFAULT 0,
     `created_at` DATETIME DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP,
     INDEX `idx_stl_user_skill` (`user_id`, `skill_name`),

migrations/021_widen_atom_id.sql

@@ -0,0 +1,7 @@
+-- 021: 加宽 skill_trajectory_links.atom_id 列
+-- 背景：atom_id 实际值形如 "{trajectory_id}_atom_{i}"（UUID 36 + "_atom_" + 序号 ≈ 45 字符），
+-- 原 VARCHAR(36) 过短导致写入时 DataError(1406) Data too long，并使会话进入 rolled-back 状态，
+-- 级联触发 PendingRollbackError 与日志 trace_id KeyError 刷屏。
+-- 本迁移幂等：重复执行 MODIFY 到相同类型为无害 no-op。
+
+ALTER TABLE `skill_trajectory_links` MODIFY COLUMN `atom_id` VARCHAR(128) NULL;