fix: 加宽 skill_trajectory_links.atom_id 列 VARCHAR(36)->128 修复 DataError(1406)；TraceIdFilter 从 root logger 移至 handler 修复子 logger %(trace_id)s KeyError 日志刷屏；evolution scheduler 循环增加 db.rollback() 兜底；附带 models.py CRLF->LF 归一。

migrations/007_evolution_tables.sql

@@ -70,7 +70,7 @@ CREATE TABLE IF NOT EXISTS `skill_trajectory_links` (
     `skill_name` VARCHAR(200) NOT NULL,
     `user_id` VARCHAR(36) NOT NULL,
     `trajectory_id` VARCHAR(36),
-    `atom_id` VARCHAR(36),
+    `atom_id` VARCHAR(128),
     `weightscore` INT DEFAULT 0,
     `created_at` DATETIME DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP,
     INDEX `idx_stl_user_skill` (`user_id`, `skill_name`),

migrations/021_widen_atom_id.sql

@@ -0,0 +1,7 @@
+-- 021: 加宽 skill_trajectory_links.atom_id 列
+-- 背景：atom_id 实际值形如 "{trajectory_id}_atom_{i}"（UUID 36 + "_atom_" + 序号 ≈ 45 字符），
+-- 原 VARCHAR(36) 过短导致写入时 DataError(1406) Data too long，并使会话进入 rolled-back 状态，
+-- 级联触发 PendingRollbackError 与日志 trace_id KeyError 刷屏。
+-- 本迁移幂等：重复执行 MODIFY 到相同类型为无害 no-op。
+
+ALTER TABLE `skill_trajectory_links` MODIFY COLUMN `atom_id` VARCHAR(128) NULL;